32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5180 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  73.91 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  74.67 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  74.6 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  70.91 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  68.34 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  69.31 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  43.38 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  45.56 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  43.2 
 
 		 565 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  42.67 
 
 		 565 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  43.47 
 
 		 553 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  41.16 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  36.39 
 
 		 381 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  36.93 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  37.85 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  39.56 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  36.69 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  36.39 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  32.33 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  34.29 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  28.27 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  29.01 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.97 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.77 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25.43 
 
 		 352 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  27.22 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  24.81 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  28.7 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  27.98 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  32.63 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>