71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3141 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  45.18 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  41.5 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  38.61 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  38.61 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  36.05 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  40.89 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  37.41 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  38.96 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  38.78 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  39.33 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  39.19 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  37.43 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  38.12 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  37.76 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4241  HupE/UreJ protein  33.33 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2281  HupE/UreJ protein  36.5 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0993  HupE/UreJ protein  37.02 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1953  hydrogenase accessory protein  29.48 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.776379  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  30.98 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  30.98 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  30.98 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  30.98 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  34.44 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0959  HupE/UreJ protein  33.83 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355166  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0886  HupE/UreJ protein  33.97 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.219262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  30.98 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1863  HupE/UreJ protein  35.93 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.867351  normal  0.454948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2186  HupE/UreJ protein  37.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  34.21 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  36.36 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  30.43 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  37.38 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  29.89 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  37.4 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3374  hypothetical protein  36.43 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  29.89 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  35.35 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2034  urease accessory UREJ transmembrane protein  35.76 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0976  HupE/UreJ protein  42.73 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  31.61 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  28.8 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0479  hydrogenase/urease accessory protein  31.06 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230165  normal  0.16849 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  31.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  31.89 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  26.42 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.4167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2847  HupE/UreJ protein  32.03 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  33.12 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2842  HupE/UreJ protein  32.03 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  37.04 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3272  urease accessory protein UreJ  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50400  HupE/UreJ protein  34 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  32.72 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0180  HupE/UreJ protein  36.53 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.683623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  33.86 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1195  HupE/UreJ protein  30.29 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108904  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6538  HupE/UreJ protein  36.43 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436397  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1265  urease accessory protein UreJ  32.39 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6126  HupE/UreJ protein  34.23 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549865  normal  0.331316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1166  HupE/UreJ protein  35.88 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  33.54 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2933  HupE/UreJ protein  33.54 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.629521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0663  HupE/UreJ protein  37.4 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.32608  normal  0.0353183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  32.49 
 
 		 194 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2148  HupE/UreJ protein  36.15 
 
 		 191 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140678  normal  0.213077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2682  HupE/UreJ protein  32.42 
 
 		 194 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.669277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  34.71 
 
 		 202 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3527  HupE/UreJ protein  34.23 
 
 		 197 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1973  HupE/UreJ protein  34.21 
 
 		 196 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2825  HupE/UreJ protein  31.37 
 
 		 196 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2123  HupE/UreJ protein  32.45 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>