More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3116 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1431    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  65.06 
 
 		 719 aa  932    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  80.91 
 
 		 722 aa  1170    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  78.09 
 
 		 709 aa  1111    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  80.08 
 
 		 722 aa  1172    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  34.34 
 
 		 680 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 680 aa  416  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  38.49 
 
 		 707 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  35.88 
 
 		 689 aa  412  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  34.71 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  36.63 
 
 		 707 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 687 aa  392  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  34.95 
 
 		 687 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 705 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  35.99 
 
 		 676 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  41.96 
 
 		 704 aa  344  4e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 753 aa  336  7e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.63 
 
 		 696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.35 
 
 		 711 aa  319  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 706 aa  312  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.6 
 
 		 698 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.89 
 
 		 697 aa  303  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 703 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 702 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 702 aa  300  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  43.97 
 
 		 669 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.3 
 
 		 699 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  39.27 
 
 		 696 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 		 701 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.96 
 
 		 929 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  35.98 
 
 		 700 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  37.72 
 
 		 698 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  35.08 
 
 		 915 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.92 
 
 		 706 aa  270  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.41 
 
 		 698 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 		 918 aa  267  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.79 
 
 		 892 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.33 
 
 		 892 aa  263  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.1 
 
 		 699 aa  263  8.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  27.29 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.25 
 
 		 660 aa  260  6e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  31.9 
 
 		 883 aa  260  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.71 
 
 		 911 aa  259  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 705 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.77 
 
 		 905 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 712 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.44 
 
 		 711 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.95 
 
 		 921 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.79 
 
 		 912 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  35.39 
 
 		 508 aa  253  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 477 aa  252  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  32.68 
 
 		 920 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  36.68 
 
 		 698 aa  251  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  33.48 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.88 
 
 		 897 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  33.87 
 
 		 709 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 705 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.95 
 
 		 895 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.31 
 
 		 707 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.18 
 
 		 893 aa  243  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.8 
 
 		 889 aa  243  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.64 
 
 		 699 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 		 907 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.51 
 
 		 900 aa  241  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.56 
 
 		 704 aa  241  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.88 
 
 		 695 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.45 
 
 		 697 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  34.2 
 
 		 461 aa  238  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  31.26 
 
 		 711 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 907 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 727 aa  231  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 451 aa  231  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 913 aa  229  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 451 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.95 
 
 		 728 aa  227  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 		 907 aa  227  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  31.21 
 
 		 893 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 911 aa  225  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.2 
 
 		 750 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  30.43 
 
 		 697 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  29.53 
 
 		 903 aa  220  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  36.86 
 
 		 904 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 693 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  36.08 
 
 		 693 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 887 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 893 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 893 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.08 
 
 		 700 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.46 
 
 		 710 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 		 897 aa  210  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 		 703 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  28.98 
 
 		 897 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>