131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1788 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  76.42 
 
 
231 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  73.36 
 
 
231 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  70.31 
 
 
231 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.59 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  49.13 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  50.66 
 
 
236 aa  234  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.44 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.8 
 
 
229 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  53.92 
 
 
229 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  50 
 
 
226 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  47.42 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  45.25 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  43.83 
 
 
236 aa  194  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
229 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 
232 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  37.44 
 
 
222 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  36.32 
 
 
237 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  34.7 
 
 
279 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  41.58 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  25.7 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  38.1 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  28.21 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  26.98 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  38.46 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.46 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.36 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  34.31 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  24.74 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  31.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.77 
 
 
207 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  22.87 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.53 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.64 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.64 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.53 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  38.64 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  40.86 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  29.05 
 
 
313 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  38.95 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  28.1 
 
 
312 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  24.08 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  35.23 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  35.87 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  39.13 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  23.29 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  20.33 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  36.26 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.26 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  25.5 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  26.5 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  33.08 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  37.36 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  36.26 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  20.33 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  35.16 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  26.73 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  36.26 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  35.42 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  25.47 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  26.29 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  29.38 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  29.38 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  35.92 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  35.23 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  25.13 
 
 
241 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.52 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  24.66 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  31.82 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  34.58 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  34.07 
 
 
205 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.43 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  27.62 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.74 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  35.65 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  34.48 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  29.09 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  32.95 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  33.33 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  33.98 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  33.33 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  28.7 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  32.93 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  35.53 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  32.18 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  35.53 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  28.69 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  23.44 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  36.96 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  30.3 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>