More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0878 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  68.81 
 
 		 478 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 479 aa  991    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  75.78 
 
 		 476 aa  768    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  75.16 
 
 		 486 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  62.58 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  59.88 
 
 		 479 aa  594  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  49.39 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  47.05 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  48.57 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  43.58 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  37.68 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  33.91 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  33.12 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  32.91 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.2 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.05 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  31.58 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.62 
 
 		 447 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.55 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.67 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  34.07 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  31.35 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.19 
 
 		 466 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.19 
 
 		 466 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  31.66 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.06 
 
 		 476 aa  199  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  32.98 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.06 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  32.44 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  30.95 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  30.95 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  30.43 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.57 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  31 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  31.89 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  32.68 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.14 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  31.66 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  30.43 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.85 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  30.85 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  30.74 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.51 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  29.8 
 
 		 474 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 443 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.93 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  31.08 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  28.78 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  31.62 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  32.23 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  30.21 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  30.54 
 
 		 455 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  30.46 
 
 		 444 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  30.54 
 
 		 455 aa  189  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.94 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.51 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  31.93 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  31.24 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.87 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  30.79 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  31.74 
 
 		 450 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  31.94 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  30.26 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  31.08 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  30.74 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  30.8 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.51 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  31.26 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.44 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  31.39 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.85 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  30.16 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  29.31 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  30.35 
 
 		 447 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  29.61 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  34.19 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  31.17 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  30.11 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  30.87 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>