More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0276 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  70.56 
 
 
462 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  69.48 
 
 
462 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  100 
 
 
460 aa  918    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  69.2 
 
 
461 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  68.83 
 
 
462 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  55.51 
 
 
478 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  55.61 
 
 
459 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  55.61 
 
 
459 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  54.81 
 
 
452 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  44.44 
 
 
457 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  43.12 
 
 
450 aa  302  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  40.89 
 
 
462 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  40.72 
 
 
470 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  43.52 
 
 
455 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  39.37 
 
 
467 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  39.27 
 
 
466 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  39.27 
 
 
466 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  39.47 
 
 
464 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  37.88 
 
 
466 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  38.23 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  38.8 
 
 
465 aa  259  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  36.55 
 
 
480 aa  252  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  35.84 
 
 
466 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  37.25 
 
 
464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  33.11 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  36.91 
 
 
462 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  33.65 
 
 
454 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.56 
 
 
463 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  35.89 
 
 
453 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  36.01 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  36.72 
 
 
463 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  35.53 
 
 
470 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.38 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.82 
 
 
452 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  36.31 
 
 
441 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.19 
 
 
462 aa  213  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.4 
 
 
448 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  35.68 
 
 
466 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  36.1 
 
 
471 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  34.02 
 
 
452 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  37.02 
 
 
473 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  35.85 
 
 
471 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  33.5 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  35.31 
 
 
482 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  34.04 
 
 
458 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  34.81 
 
 
1365 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  37.01 
 
 
452 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  30.47 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  34.22 
 
 
449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  30.87 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  30.87 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  30.61 
 
 
453 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  31.99 
 
 
459 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.42 
 
 
446 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  33.83 
 
 
454 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  32.1 
 
 
458 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  34.96 
 
 
437 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  35.73 
 
 
452 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.16 
 
 
445 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  30.86 
 
 
1380 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  31.1 
 
 
1373 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  29.69 
 
 
463 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  31.41 
 
 
447 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  29.16 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.86 
 
 
1373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.1 
 
 
1373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.1 
 
 
1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.1 
 
 
1373 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.1 
 
 
1373 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.1 
 
 
1373 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  36.05 
 
 
429 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.68 
 
 
459 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  34.14 
 
 
453 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  32.67 
 
 
449 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  30.4 
 
 
460 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.25 
 
 
445 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  31.01 
 
 
444 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.7 
 
 
457 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  28.25 
 
 
432 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  31.18 
 
 
455 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  30.91 
 
 
431 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  32.94 
 
 
489 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  29.77 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  29.77 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  30.65 
 
 
546 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.87 
 
 
439 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  32.01 
 
 
430 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.24 
 
 
445 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  33.67 
 
 
452 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  27.49 
 
 
463 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  29.64 
 
 
459 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.64 
 
 
446 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  34.04 
 
 
474 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  34.04 
 
 
474 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.68 
 
 
447 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  31.47 
 
 
473 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  33.42 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  31.14 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.05 
 
 
451 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  30.85 
 
 
462 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>