More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5277 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  100 
 
 		 535 aa  1102    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  40.91 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  38.57 
 
 		 513 aa  319  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  34.43 
 
 		 491 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  27.36 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  29.71 
 
 		 509 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  27.42 
 
 		 431 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  27.75 
 
 		 466 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  31.14 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1055  amidohydrolase  31.66 
 
 		 503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.89 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  27.51 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.25 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  29.13 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.77 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  28.47 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.59 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.34 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.07 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  26.19 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  28.42 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  27.72 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.01 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.5 
 
 		 428 aa  127  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  24.32 
 
 		 431 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  28.12 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.64 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.67 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.67 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.07 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  23.57 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.27 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.47 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.78 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.78 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.54 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.32 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.59 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  28.25 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.49 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.19 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  27.91 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  29.71 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.41 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  24.42 
 
 		 455 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.41 
 
 		 470 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.74 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.9 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.81 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.5 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  27.41 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.13 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  27.41 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  25.85 
 
 		 440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  26.68 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.06 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.92 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  27.78 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.96 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  25 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  26.25 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  26.35 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.22 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.37 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.96 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.28 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.04 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.05 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  29.37 
 
 		 464 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.05 
 
 		 465 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.18 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  26.51 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.66 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.59 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  26.36 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  26.98 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.89 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.59 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.59 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.91 
 
 		 446 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  26.98 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.93 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.54 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.3 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.54 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.13 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.34 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.01 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  27.65 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.7 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  25.05 
 
 		 656 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  27.35 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  24.6 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.48 
 
 		 444 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  26.62 
 
 		 473 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  24.77 
 
 		 429 aa  103  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>