56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1920 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  68.47 
 
 		 513 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  69.05 
 
 		 511 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  75.05 
 
 		 504 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  83.56 
 
 		 504 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1058    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  69.49 
 
 		 514 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  84.33 
 
 		 503 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  64.59 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  63.23 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  60.96 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  60.76 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  60.36 
 
 		 499 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  59.92 
 
 		 507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  60.04 
 
 		 498 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  58.69 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62.63 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  59.6 
 
 		 506 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  59.05 
 
 		 504 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  59.44 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  59.68 
 
 		 498 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  57.61 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  58.35 
 
 		 502 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  58 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  55.62 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  53.86 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  30.46 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.65 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.29 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.53 
 
 		 250 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.53 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.33 
 
 		 628 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.12 
 
 		 659 aa  53.9  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  26.58 
 
 		 580 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.92 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.91 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 550 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  30.73 
 
 		 611 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  27.81 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  28.49 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.07 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  28.49 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.24 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1144 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  29.05 
 
 		 605 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  28.7 
 
 		 581 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.18 
 
 		 608 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  25.71 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  36.11 
 
 		 579 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.52 
 
 		 570 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.81 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  23.44 
 
 		 659 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.45 
 
 		 508 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.22 
 
 		 560 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  28.21 
 
 		 567 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>