31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1013 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.19 
 
 		 189 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.08 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.39 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.4 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.68 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.78 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.6 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.36 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.51 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.36 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.25 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  36.24 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  39.6 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.93 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.14 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  35.86 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.69 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.44 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  37.66 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.67 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.9 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.25 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.62 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.98 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.14 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.34 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.17 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>