45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4909 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  47.44 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  47.89 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  49.3 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  43.66 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  42.59 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  42.59 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  46.19 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  45.55 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  45.71 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  45.36 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  41.67 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  38.94 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  38.94 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  40.64 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  34.65 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  36.47 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  30.1 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  34.83 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  32.32 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  34.56 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  30.61 
 
 		 189 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  34.78 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  32.74 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  26.6 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  31.16 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  30.69 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  30.69 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  30.69 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  34.26 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  31.84 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  31.84 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  29.47 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  28.86 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  29.25 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  28.7 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  28.25 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  27.27 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  31.44 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  30.41 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  30.77 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  30.93 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  31.31 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  25.13 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  27.27 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>