More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1263 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  89.81 
 
 
471 aa  828    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
478 aa  954    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  64.9 
 
 
476 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  65.34 
 
 
479 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  60.18 
 
 
460 aa  524  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  58.99 
 
 
481 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  60.94 
 
 
491 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  60.69 
 
 
465 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.4 
 
 
463 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.25 
 
 
464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  60.49 
 
 
471 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.99 
 
 
460 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  54.98 
 
 
493 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  58.79 
 
 
468 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  57.38 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  58.17 
 
 
495 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  57.11 
 
 
468 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.96 
 
 
506 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  57.85 
 
 
467 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.87 
 
 
480 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  56.41 
 
 
467 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  54.82 
 
 
470 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  56.53 
 
 
467 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  56.14 
 
 
483 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.72 
 
 
467 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  57.24 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  56.93 
 
 
463 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  53.18 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  53.4 
 
 
471 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  54.47 
 
 
471 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  53.32 
 
 
470 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  52.25 
 
 
463 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  53.32 
 
 
470 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  53.32 
 
 
470 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  54.18 
 
 
467 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
465 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.28 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
470 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
562 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
465 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
470 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
468 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.55 
 
 
471 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 
468 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.73 
 
 
465 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.55 
 
 
448 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
469 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 
465 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
470 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
470 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
470 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.68 
 
 
471 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
470 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
470 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
465 aa  226  9e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 
465 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 
471 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
459 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
469 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
484 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
470 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
484 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 
467 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
473 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
467 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.2 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
470 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  32.53 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 
459 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 
459 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
459 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 
459 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 
459 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
459 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
459 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.9 
 
 
473 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
585 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
466 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  32.97 
 
 
481 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.73 
 
 
459 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
468 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 
466 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  32.31 
 
 
476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.06 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>