46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1123 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  79.03 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  48.47 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  48.19 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  43.96 
 
 		 207 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  45.06 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  45.06 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  41.07 
 
 		 220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  38.69 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  40.96 
 
 		 179 aa  130  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  40.51 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  41.81 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  41.67 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  38.46 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  41.45 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  37.72 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  39.51 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  37.34 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  26.7 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  26.86 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  26.86 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  26.86 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  29.66 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  27.42 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  29.17 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.99 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  27.54 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  30.37 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  26.61 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1521  hypothetical protein  29.06 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  33.05 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2630  2'-5' RNA ligase  31.45 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.987674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2951  2'-5' RNA ligase  31.45 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2904  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  25.97 
 
 		 215 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2653  hypothetical protein  31.75 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 169 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  31.45 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>