251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0064 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0027  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00837628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0272  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2522  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2533  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0263  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.534581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2226  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000065452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2237  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0036  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350456  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0019  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.512808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0039  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2042  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000171349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1685  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.443459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1763  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2135  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00369966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2210  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0049  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0408586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0046  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1470  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>