More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1638 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  100 
 
 		 350 aa  702    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  25.62 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  28.75 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  25.21 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  29.35 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  28.57 
 
 		 481 aa  99.4  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.21 
 
 		 453 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  24.71 
 
 		 405 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  34.73 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  27.35 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  25.3 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  26.21 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  29.51 
 
 		 435 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 		 441 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  25.97 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  25.97 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  30.97 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  31.21 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  25.97 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  27.16 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  31.21 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  26.72 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  28.78 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  25.52 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  25.97 
 
 		 430 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  25.97 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  25.97 
 
 		 430 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  25.97 
 
 		 430 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  25.97 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  25.97 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  25.81 
 
 		 436 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  25.57 
 
 		 406 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  29.27 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  26.73 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  27.78 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  28.78 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  31.61 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  23.93 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  26.11 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  29.73 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  25.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  26.21 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  23.29 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  25.1 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  26.63 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  27.4 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  23.29 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  25.37 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  24.58 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  28.85 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  26.98 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  26.9 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  23.08 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  25.73 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  26.83 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.37 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  23.91 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  23.04 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  26.49 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  24.23 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  26.04 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  24.88 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  23.67 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  26.06 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  24.29 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  28.39 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  28.5 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  23.77 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  27.54 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  27.71 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  32.8 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  27.22 
 
 		 430 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  25.91 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  24.41 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  21.55 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  22.97 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  25.44 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  26.06 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  23.04 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  25.99 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  24.87 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.11 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.11 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.35 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.35 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  26.37 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  22.12 
 
 		 436 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  22.98 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  25.75 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.37 
 
 		 445 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  25.99 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  21.05 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  22.39 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  25.21 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  25.48 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>