More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6548 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
232 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  58.19 
 
 
207 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  54.63 
 
 
210 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  52.84 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  50.22 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  49.61 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  52.17 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  52.42 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  52.97 
 
 
211 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  54.13 
 
 
215 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  52.51 
 
 
211 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  52.51 
 
 
211 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  49.78 
 
 
218 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  43.56 
 
 
254 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  49.32 
 
 
243 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  47.52 
 
 
227 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  46.93 
 
 
191 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  44.62 
 
 
240 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  48.95 
 
 
231 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  48.94 
 
 
225 aa  151  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  47.6 
 
 
212 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  42.16 
 
 
287 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  44.75 
 
 
218 aa  148  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  48.5 
 
 
225 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  50.85 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  47.39 
 
 
216 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  51.47 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  43.1 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  43.35 
 
 
223 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 
229 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  45 
 
 
241 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.14 
 
 
224 aa  121  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  45.19 
 
 
225 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  42.5 
 
 
222 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.16 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  38.29 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.31 
 
 
244 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  37.22 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  37.44 
 
 
231 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  33.48 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  37.07 
 
 
232 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  29.07 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  36.09 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  31.03 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  31.18 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  34.07 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  35.04 
 
 
250 aa  85.1  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  27.43 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  29.61 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  33.88 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  36.44 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  36.77 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  36.77 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  34.91 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  38.24 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  33.48 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  28.38 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  30.17 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  35.87 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  28.7 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  27.87 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.61 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  37.41 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  36.9 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  32.39 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  35.11 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  38.92 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  32.89 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.63 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  31.94 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  39.26 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  31.94 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  36.13 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.94 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  31.02 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.94 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.94 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.74 
 
 
781 aa  77  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  37.23 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0810  peptidase M22, glycoprotease  36.28 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  32.2 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  28.7 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  31.96 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  39.85 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  39.26 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  30.24 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.88 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  34.22 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  29.05 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  34.19 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  39.74 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  39.23 
 
 
891 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  35.9 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  32.02 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0370  peptidase M22 glycoprotease  37.32 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>