More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0915 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  55.4 
 
 
238 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
256 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  37.67 
 
 
246 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  37.62 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  36.19 
 
 
279 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  38.5 
 
 
252 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  36.79 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  35.98 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  34.45 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  37.8 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  36.45 
 
 
246 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  36.92 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  35.64 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  35.05 
 
 
224 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.67 
 
 
234 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.05 
 
 
224 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  35.05 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  34.11 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  35.89 
 
 
276 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  35.05 
 
 
224 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  32.86 
 
 
227 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  34.58 
 
 
224 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  37.98 
 
 
229 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  35.98 
 
 
225 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  36.22 
 
 
236 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.22 
 
 
236 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  35.19 
 
 
226 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  32.71 
 
 
228 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.2 
 
 
223 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  33.67 
 
 
236 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  32.04 
 
 
233 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  31.86 
 
 
235 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
236 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  35.19 
 
 
226 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  32.69 
 
 
236 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.67 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  34.18 
 
 
237 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  32.5 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  34.18 
 
 
237 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  32.5 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  32.5 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  34.18 
 
 
237 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  34.18 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  33.67 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.64 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  32.5 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  32.5 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  32.43 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  33.82 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.67 
 
 
236 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  33.51 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  33.01 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.17 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  36.11 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  35.19 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  32.32 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  31.13 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  30.56 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  32.39 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.04 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  32.04 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  32.04 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  31.63 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  33.01 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  35.65 
 
 
255 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  31.6 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  34.72 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  35.65 
 
 
255 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  30.88 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  31.6 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  31.6 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  34.72 
 
 
255 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  30.88 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  45.1 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  33.8 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  38.21 
 
 
259 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  31.22 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  33.67 
 
 
283 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  33.17 
 
 
233 aa  92  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  42.2 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  32.69 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  32.54 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  30.7 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.1 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  42.06 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  41.23 
 
 
255 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  34.43 
 
 
231 aa  89  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  29.9 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  39.44 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>