186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0939 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0939  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0334  putative metal-dependent proteases-like protein  50.34 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  32.19 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  30.34 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  29.1 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  29.81 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  26.18 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  25.74 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  29.17 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  27.46 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  29.46 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  27 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  28.57 
 
 		 218 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  30.74 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  28.31 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  29.13 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  27.21 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  27.24 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  28.76 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  26.87 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  28.31 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  25.75 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  26.29 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  29.41 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  27.05 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  28.69 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  27 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  25.67 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  32.7 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  32.82 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  26.97 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  27.27 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  32.82 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  27.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  28.78 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  32.06 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  32.06 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1236  peptidase M22 glycoprotease  40.26 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  31.68 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  25.68 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  30.46 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  26.84 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  28 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  23.63 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  27.02 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  35.87 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  30.43 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  29.27 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  22.48 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  39.29 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  26.82 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  23.97 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  27.88 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  26.11 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  26.97 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  25.17 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0964  peptidase M22 glycoprotease  36.99 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  26.94 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  35.48 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  26.22 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  24.55 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  26.47 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  40.62 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  28.47 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  27.05 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  26.15 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  25.5 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  27.04 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  36.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  26.72 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  30.4 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  25 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  26.09 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0210  endopeptidase-related protein  34.02 
 
 		 191 aa  49.7  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  30.95 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  25.29 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  36.84 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  24.77 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  25.95 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  25.95 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  25.95 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  30.25 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  31.71 
 
 		 233 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  23.63 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  25.58 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>