164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4493 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4493  Thioesterase  100 
 
 
255 aa  503  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3447  Thioesterase  44.35 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3426  Thioesterase  39.33 
 
 
243 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.94 
 
 
255 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  39.52 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  39.81 
 
 
260 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  39.81 
 
 
265 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  39.81 
 
 
265 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.76 
 
 
251 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.76 
 
 
251 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.61 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.35 
 
 
1337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  30.99 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.39 
 
 
281 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.26 
 
 
278 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  37.33 
 
 
257 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.49 
 
 
291 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  34.98 
 
 
260 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  31.09 
 
 
248 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  29.75 
 
 
252 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.06 
 
 
278 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.4 
 
 
260 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  29.88 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.74 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.12 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.33 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  35.57 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  35.57 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  35.57 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.25 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  35.62 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.95 
 
 
2125 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  31.89 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.91 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  32.82 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  34.73 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  35.15 
 
 
259 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  34.39 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 
1354 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.91 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.35 
 
 
251 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.45 
 
 
253 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  32.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  31.49 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  29.13 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  29.13 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  35.24 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  31.28 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.07 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.76 
 
 
271 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  30.42 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.41 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  28.26 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  37.56 
 
 
254 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  34.56 
 
 
245 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  31.06 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.19 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  26.51 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  32.63 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  35.37 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  36.76 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  33.33 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  32.14 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.42 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  34.58 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  33.48 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.13 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  33.48 
 
 
239 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  31.86 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.93 
 
 
832 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  32.86 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  30.21 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  30.21 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  25.65 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  33.48 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  31.96 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  32.33 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  32.03 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  25 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  34.68 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  33.6 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  24.89 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  25.64 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  31.9 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3848  thioesterase  31.44 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335198  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5776  thioesterase  31.75 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261382  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.48 
 
 
2839 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.48 
 
 
2832 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.48 
 
 
2839 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  24.69 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  33.48 
 
 
2832 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  28.21 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  25.96 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  31.58 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  30.53 
 
 
1414 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  29.44 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  33.04 
 
 
2835 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>