26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4140 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  78.14 
 
 		 557 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  39.15 
 
 		 597 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  31.89 
 
 		 414 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1291 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  30.24 
 
 		 412 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  28.64 
 
 		 594 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1465 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  34.69 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.81 
 
 		 1509 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  33.8 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  32.35 
 
 		 1488 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3479  hypothetical protein  32.96 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  28.31 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  30.95 
 
 		 2144 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  28.77 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  27.57 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  29.36 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  40.48 
 
 		 229 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1487  hypothetical protein  24.67 
 
 		 539 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03830  hypothetical protein  25.2 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  28.19 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  24.39 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  26.26 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>