More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3674 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 860 aa  1670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.83 
 
 		 3002 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.42 
 
 		 3021 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  25.66 
 
 		 1514 aa  325  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  28.32 
 
 		 2230 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.18 
 
 		 2454 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  25.98 
 
 		 1157 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  26.38 
 
 		 1157 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  31.46 
 
 		 2350 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  27.05 
 
 		 3252 aa  198  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  26.39 
 
 		 1084 aa  191  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  26.44 
 
 		 3739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  29.77 
 
 		 1334 aa  180  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  24.88 
 
 		 3086 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  23.36 
 
 		 1922 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  24.56 
 
 		 3086 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  28.79 
 
 		 3650 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  28.18 
 
 		 1405 aa  170  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  31.61 
 
 		 1734 aa  170  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  24.07 
 
 		 2338 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  26.22 
 
 		 2386 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.65 
 
 		 5953 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  30.26 
 
 		 2310 aa  167  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.99 
 
 		 6889 aa  167  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  24.07 
 
 		 2345 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  24.07 
 
 		 2336 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  29.3 
 
 		 2619 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  31.48 
 
 		 2174 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  26.44 
 
 		 9498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.55 
 
 		 6676 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  26.36 
 
 		 2164 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  29.82 
 
 		 2258 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  26.69 
 
 		 13537 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  30.19 
 
 		 1317 aa  160  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  28.73 
 
 		 2057 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  27 
 
 		 1862 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  30.53 
 
 		 2896 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  29.24 
 
 		 2706 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  25.4 
 
 		 1336 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  28.23 
 
 		 4136 aa  157  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  28.35 
 
 		 4991 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 		 1321 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.43 
 
 		 2385 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  28.89 
 
 		 1304 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1042 aa  155  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.11 
 
 		 7310 aa  155  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  26.13 
 
 		 3308 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  31.5 
 
 		 1158 aa  155  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.26 
 
 		 2385 aa  155  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  25.34 
 
 		 3194 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.57 
 
 		 4531 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  27.14 
 
 		 1383 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 		 2200 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  25.13 
 
 		 3293 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  26.55 
 
 		 3875 aa  152  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  25.76 
 
 		 2581 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  27.58 
 
 		 5149 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  23.59 
 
 		 888 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  24.83 
 
 		 1714 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  30.13 
 
 		 4165 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  27.66 
 
 		 3639 aa  151  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.95 
 
 		 3629 aa  150  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  26.08 
 
 		 2386 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.88 
 
 		 2385 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.66 
 
 		 1487 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.86 
 
 		 4478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  29.05 
 
 		 4383 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  30.43 
 
 		 1835 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  24.06 
 
 		 2410 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  22.65 
 
 		 1556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  22.97 
 
 		 1556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.25 
 
 		 2385 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  26.62 
 
 		 2385 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  29.64 
 
 		 1520 aa  147  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.37 
 
 		 8646 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  27.94 
 
 		 7712 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.68 
 
 		 3432 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.74 
 
 		 1336 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  29.64 
 
 		 1483 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  28.6 
 
 		 5372 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  29.64 
 
 		 1483 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  29.64 
 
 		 1528 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  26.26 
 
 		 1753 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1439 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  29.41 
 
 		 2626 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  25.58 
 
 		 2156 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.38 
 
 		 2448 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.8 
 
 		 2385 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  26.44 
 
 		 2385 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 		 1405 aa  145  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  24.92 
 
 		 627 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  25.71 
 
 		 2156 aa  144  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.27 
 
 		 3176 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  28.5 
 
 		 2439 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 1174 aa  144  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  24.72 
 
 		 9175 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.23 
 
 		 1816 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  24.76 
 
 		 6202 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.08 
 
 		 2352 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  27.76 
 
 		 5328 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>