293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2333 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 250 aa  457  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  51.39 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  42.06 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  47.89 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  66.32 
 
 		 123 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  45.37 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  62.82 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2013  flagellar motor switch protein FliN  33.6 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  57.65 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  60.76 
 
 		 359 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.79 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  56.41 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  59.74 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  59.74 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  58.97 
 
 		 398 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  52.13 
 
 		 97 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  60.53 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  59.04 
 
 		 375 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 97 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  51.06 
 
 		 97 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.91 
 
 		 357 aa  98.6  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  55.42 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  61.33 
 
 		 372 aa  95.9  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  55.84 
 
 		 417 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  47.37 
 
 		 175 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  49.4 
 
 		 155 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.94 
 
 		 370 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  46.32 
 
 		 375 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  58.33 
 
 		 113 aa  95.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  53.57 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  48.19 
 
 		 402 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  52.44 
 
 		 155 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  47.73 
 
 		 393 aa  92.4  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  53.57 
 
 		 95 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  44.34 
 
 		 142 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  57.33 
 
 		 401 aa  91.7  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  49.4 
 
 		 155 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  48.86 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  48.86 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  48.86 
 
 		 161 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  48.86 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 163 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  51.19 
 
 		 156 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 165 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 124 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 143 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  48.86 
 
 		 163 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.83 
 
 		 175 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  50.6 
 
 		 135 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 165 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 162 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 159 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 170 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 162 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 		 162 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  52 
 
 		 147 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 143 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  42.59 
 
 		 180 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 		 190 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  44.79 
 
 		 157 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  44.79 
 
 		 157 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  48.81 
 
 		 155 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  48.75 
 
 		 142 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 		 99 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  51.32 
 
 		 154 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  42.71 
 
 		 174 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.95 
 
 		 143 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  54.67 
 
 		 381 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  53.42 
 
 		 406 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  48.15 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  49.37 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  48.15 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 161 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 152 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 152 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 152 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  49.37 
 
 		 154 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.75 
 
 		 151 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 154 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 		 103 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  48.72 
 
 		 142 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 137 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 153 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>