86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1605 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  478  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  39.53 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  36.21 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0693  Abortive infection protein  30.57 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  40 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  37.27 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  36.08 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  31.63 
 
 
287 aa  52  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  38.78 
 
 
235 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  27.78 
 
 
453 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  31.98 
 
 
243 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  38.27 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  26.11 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40.62 
 
 
420 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  34.31 
 
 
362 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  35.65 
 
 
528 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  30.89 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  37.74 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  39 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  39.64 
 
 
345 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  36.56 
 
 
420 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.65 
 
 
527 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.65 
 
 
527 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  31.78 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  35.16 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  27.98 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  35.96 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  34.78 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30.85 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  28.65 
 
 
480 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  35.29 
 
 
337 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  39.08 
 
 
336 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  28.74 
 
 
302 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  31.73 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  33.33 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  38.14 
 
 
140 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  34.12 
 
 
337 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  38.14 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  38.14 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  26.39 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  33 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  31.37 
 
 
340 aa  45.8  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  31.29 
 
 
453 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 
337 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  32.95 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  34.07 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  32.94 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  33.94 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  32.94 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  24.53 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  32.94 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  32.35 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  34.29 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  33.33 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  38.64 
 
 
515 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  36.47 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  32.43 
 
 
521 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  29.7 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.76 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  36.17 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  29.79 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  35.51 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  32.99 
 
 
338 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  32.98 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09730  CAAX amino terminal protease family  39.02 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648802  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  33.98 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  28.74 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  33.96 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  33.96 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  33.96 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  31.45 
 
 
448 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  31.45 
 
 
448 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  35.96 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  33.33 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>