More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0978 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  100 
 
 		 276 aa  557  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  98.19 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  87.45 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  84.5 
 
 		 292 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1051  Integrase catalytic region  87.34 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.46 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.46 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.05 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  43.66 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  43.66 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  43.66 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  41.64 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  43.59 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  43.59 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.25 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  40.84 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  42.91 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  42.91 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.91 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  42.91 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  43.54 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  38.17 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  41.84 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 386 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  41.26 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  42.75 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>