69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3308 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  92.95 
 
 
299 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  94.63 
 
 
299 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  44.7 
 
 
405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  42.91 
 
 
405 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  35.31 
 
 
414 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  28.83 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  33.17 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  26.88 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.45 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  32.9 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  24.37 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  32.11 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  24.46 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  24.14 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  29.23 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  21.99 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  30.88 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  22.59 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  23.31 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  29.62 
 
 
274 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  24.21 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  28.12 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  26.11 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  26.11 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  25.33 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  33.17 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  25.88 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  28 
 
 
522 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  24.21 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  23.48 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  28.87 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  33.82 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  34.34 
 
 
464 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  28.79 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  27.19 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  27.41 
 
 
262 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  30.04 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  23.78 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  25.87 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  28.44 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  31.5 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  28.06 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  31.2 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  32.32 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  23.02 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  31.12 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  28.64 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  26.88 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  30.8 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  27.98 
 
 
366 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  34.81 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  27.95 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  32.92 
 
 
481 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  30.1 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  23.47 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  26.47 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  26.55 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  28.85 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  26.45 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  32.26 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  26.34 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  29.09 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  27.7 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  23.34 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>