28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2379 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  100 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  95.77 
 
 
271 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  95.38 
 
 
271 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  64.49 
 
 
276 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.31 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  25.67 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  25.26 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  24.91 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  29.29 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  25.52 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  25.66 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  27.68 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2633  putative transmembrane anti-sigma factor  36.04 
 
 
169 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  26.28 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  26.72 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  27.17 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  28.37 
 
 
322 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  31.19 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  25.17 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  30.33 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  30 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.55 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 
371 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  37.7 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  35.44 
 
 
77 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36.36 
 
 
84 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  29.89 
 
 
88 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>