15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1635 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  56.58 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  34.78 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  40 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  44.07 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  40 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  40 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4633  putative transmembrane anti-sigma factor  35.9 
 
 		 279 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  33.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  34.21 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  35.94 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.44 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  31.43 
 
 		 102 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  44.19 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  25 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>