40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1409 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  53.06 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  46.24 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  49.4 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  49.28 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  47.62 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  46.43 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  44.68 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  46.38 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  44.05 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  42.35 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  49.28 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  41.18 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  41.56 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  41.86 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  44.05 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  43.42 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  41.18 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  41.25 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  41.67 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  40.26 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  37.04 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  40.51 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  39.19 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  38.89 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  38.75 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  36.49 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  33.33 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  31.76 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  33.75 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36.36 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  31.82 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  31.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  30.14 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  36.84 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.06 
 
 		 271 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>