40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1213 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  100 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  43.59 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  37.66 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  40.28 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  40.91 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  39.19 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  42.86 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  43.59 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  37.84 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  37.14 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  39.76 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  40.74 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  35.37 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.5 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.61 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  30.43 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  35.37 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  32.56 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  33.73 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  31.76 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  36.36 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  34.88 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  34.72 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  30.88 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  35.71 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  33.78 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  31.58 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  32.18 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  28.95 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  33.85 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  31.17 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  29.73 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  33.78 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  34.85 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3637  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>