27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2650 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  84.88 
 
 		 86 aa  153  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  42.47 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  41.89 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  43.06 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  44.93 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  39.73 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  37.68 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  38.24 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  38.24 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  34.78 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  37.68 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  37.68 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36.23 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.31 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  39.13 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  37.88 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  33.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  37.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  40 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  38.6 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  36.36 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  31.58 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  37.04 
 
 		 393 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  30.3 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  39.06 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>