13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0505 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  416  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  43 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  38.42 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  39.74 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  37.78 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  50.77 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  44.62 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  37.04 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  35.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  38.74 
 
 		 303 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  28.46 
 
 		 412 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  35.06 
 
 		 327 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>