23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1007 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  43.99 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  37.91 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2920  hypothetical protein  36.63 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378243  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  33.53 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  45.12 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  41.18 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  46.99 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2514  putative transmembrane anti-sigma factor  28.8 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000642877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  49.23 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  35.33 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  44.62 
 
 		 132 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  42.67 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  41.56 
 
 		 179 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  37.18 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  37.18 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  48.94 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  39.13 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1185  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.12 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.423386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  65.62 
 
 		 158 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  44.68 
 
 		 164 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>