20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7940 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  36.56 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  54.41 
 
 		 277 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  49.23 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  44.09 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  58.82 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  38.46 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  43.94 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0090  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  44.3  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  40.28 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  36.62 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  35.14 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  56.25 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  36.49 
 
 		 327 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44.19 
 
 		 253 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  40.3 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>