14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1184 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
179 aa  347  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  36.87 
 
 
224 aa  87.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  54.22 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  38.1 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  58.82 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  52.94 
 
 
277 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  39.56 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  43.86 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  32.5 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  61.76 
 
 
303 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  29.63 
 
 
412 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.18 
 
 
376 aa  41.6  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1126  hypothetical protein  24.22 
 
 
284 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890394  normal  0.601891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>