12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3890 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  44.76 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  36.41 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  36.11 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  49.32 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  45.59 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  46.27 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  48.53 
 
 		 303 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  39.39 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0090  hypothetical protein  43.14 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  33.8 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  38.46 
 
 		 327 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>