12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  37.43 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  37.88 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  27.33 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2920  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378243  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  40.4 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  44.19 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  37.04 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  43.84 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  26.58 
 
 		 164 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  36 
 
 		 179 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>