12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3832 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  54.41 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  50.77 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  50.77 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  39.66 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  44.3 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  54.17 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  48.98 
 
 		 164 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0885  hypothetical protein  53.23 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.313498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  44.26 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>