12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1825 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  43.94 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  47.83 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  43.86 
 
 
179 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  39.56 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  48.98 
 
 
277 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  38.6 
 
 
312 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  35.42 
 
 
412 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0796  putative transmembrane anti-sigma factor  44.62 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  41.51 
 
 
224 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>