22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8415 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  62.15 
 
 		 192 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  42.53 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  38.1 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  49.23 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  38.19 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  43.84 
 
 		 334 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  43.24 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1825  hypothetical protein  43.86 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.719611  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  40.23 
 
 		 129 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  30.49 
 
 		 312 aa  47.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  34.42 
 
 		 327 aa  47.8  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  48.48 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  38.27 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  38.27 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  58.82 
 
 		 303 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>