15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2157 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  343  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  44.09 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  44.09 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  45.98 
 
 
132 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  43.84 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0796  putative transmembrane anti-sigma factor  38.89 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  40.23 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06440  hypothetical protein  38.52 
 
 
295 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  34.08 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  32.96 
 
 
196 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1858  hypothetical protein  44.23 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>