14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1124 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  49.33 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  50.75 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06440  hypothetical protein  37.76 
 
 		 295 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  49.25 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  49.25 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  47.76 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  41.33 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  49.25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0796  putative transmembrane anti-sigma factor  34.02 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  45.45 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  35.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  48.48 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  38.81 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>