16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4067 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3993  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4067  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4007  hypothetical protein  93.18 
 
 
132 aa  253  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856713  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4495  hypothetical protein  71.21 
 
 
132 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0837765  normal  0.173361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11246  hypothetical protein  80.56 
 
 
193 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246529  hitchhiker  0.00892183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2201  hypothetical protein  65.91 
 
 
133 aa  167  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1068  hypothetical protein  53.61 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2157  hypothetical protein  49.3 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00626531  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1858  hypothetical protein  60.78 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0796  putative transmembrane anti-sigma factor  51.95 
 
 
215 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1124  hypothetical protein  49.25 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06440  hypothetical protein  47.62 
 
 
295 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  42.37 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  38.27 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  37.31 
 
 
179 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0416  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.76 
 
 
211 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>