19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0781 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
80 aa  166  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  56.94 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3276  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.953611  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  45.95 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0680768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1555  putative transmembrane anti-sigma factor  37.84 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0444542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  35.38 
 
 
329 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0333  putative transmembrane anti-sigma factor  39.13 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444258  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  38.18 
 
 
465 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1835  hypothetical protein  43.64 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  32 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21560  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  34.21 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  29.41 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  27.63 
 
 
336 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1423  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  38 
 
 
78 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.54049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1547  hypothetical protein  41.3 
 
 
49 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.539405  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3637  putative transmembrane anti-sigma factor  28.99 
 
 
84 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>