106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0038 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  91.25 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  93.94 
 
 		 98 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  85 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>