108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0396 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 		 77 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60.29 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  53.62 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  52.54 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.54 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.54 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.24 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.24 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  37.31 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.48 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.43 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  39.71 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.53 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  44.07 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  40.3 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  37.31 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  40 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  36.23 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  34.29 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.77 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  40.26 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.91 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.96 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.96 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.68 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.44 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  42.59 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  35.9 
 
 		 321 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  52.5 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  35.21 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  42.59 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 93 aa  42  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  32.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.95 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01624  ATP synthase subunit 9, mitochondrial Precursor (Lipid-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16000]  41.3 
 
 		 143 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  36.54 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 107 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  54.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  38.1 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>