38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3030 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  42.37 
 
 		 336 aa  255  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  40.19 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  44.41 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  42.76 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  39.69 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  39.56 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  43.3 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  37.38 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  42.75 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  38.05 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  37.81 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  36.39 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  36.59 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  35.31 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  33.96 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  35.53 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  41.04 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  34.88 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2317  hypothetical protein  34.69 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33329  predicted protein  28.89 
 
 		 664 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00390  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative  21.31 
 
 		 1030 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  27.31 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  28.9 
 
 		 982 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  23.98 
 
 		 585 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  26.3 
 
 		 418 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 430 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  26.48 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04613  37S ribosomal protein Rsm22 (AFU_orthologue; AFUA_2G02290)  27.81 
 
 		 855 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3565  ribosomal small subunit Rsm22  29.31 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  28.03 
 
 		 394 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  42.59 
 
 		 659 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  24.2 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.69 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  30.59 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  27.08 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  35.11 
 
 		 973 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  24.14 
 
 		 446 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>