78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1544 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  100 
 
 		 504 aa  1050    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  23.8 
 
 		 550 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  24.06 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 536 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  23.9 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.57 
 
 		 616 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.36 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  22.95 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0806  amine oxidase  24.24 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  22.7 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  23.71 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  22.9 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.77 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  22.95 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  23.5 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.06 
 
 		 624 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  21.4 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  23.5 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 649 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  22.92 
 
 		 539 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.05 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.66 
 
 		 496 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  22.92 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  23.3 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  21.28 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  22.84 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  22.84 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  24.19 
 
 		 562 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 		 636 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  33.13 
 
 		 634 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  22.04 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 473 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.81 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  27.75 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  30.08 
 
 		 620 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.75 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  22.57 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  37.5 
 
 		 631 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  23.15 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  21.69 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  23.18 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.22 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  22.22 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  33.68 
 
 		 366 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 510 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  21.18 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.18 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  28.89 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  30.56 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  28.75 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  56.82 
 
 		 245 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  34.65 
 
 		 499 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  29.52 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  21.26 
 
 		 447 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.26 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  22.26 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  39.68 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  22.26 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  32.93 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  31.87 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.02 
 
 		 502 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  32.95 
 
 		 493 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  34.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3377  amine oxidase  23.72 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.719601  normal  0.101039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  28.91 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>