26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1075 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 649 aa  1316    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  37.17 
 
 		 650 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  28.99 
 
 		 634 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 650 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 636 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  27.73 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  28.48 
 
 		 620 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  24.55 
 
 		 631 aa  160  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  27.99 
 
 		 644 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  27.01 
 
 		 621 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  21.56 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 554 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.5 
 
 		 424 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  41.57 
 
 		 510 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 559 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  24.28 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.19 
 
 		 499 aa  45.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.95 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.98 
 
 		 451 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  42.65 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 554 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  46.15 
 
 		 424 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>