13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3641 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  58.56 
 
 		 620 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  57.92 
 
 		 620 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 636 aa  1323    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  58.4 
 
 		 621 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  56.8 
 
 		 631 aa  750    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  43.28 
 
 		 634 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  42.41 
 
 		 610 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 650 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  40.44 
 
 		 612 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  38.79 
 
 		 644 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 630 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  25.61 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>