76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3484 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  85.29 
 
 
136 aa  234  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  65.89 
 
 
133 aa  167  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  67.94 
 
 
134 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  67.18 
 
 
134 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  67.18 
 
 
134 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  65.62 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  64.12 
 
 
133 aa  164  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  61.19 
 
 
135 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  66.39 
 
 
127 aa  154  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  63.64 
 
 
134 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  56.06 
 
 
132 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  62.41 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  64.84 
 
 
132 aa  143  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  56.92 
 
 
132 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  62.77 
 
 
133 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  63.85 
 
 
140 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  59.69 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  56.59 
 
 
131 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  55.38 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  54.48 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  56.39 
 
 
135 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  57.03 
 
 
141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  51.88 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 
141 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  55.47 
 
 
130 aa  127  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  56.59 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  57.02 
 
 
163 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  54.76 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  42.54 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.16 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 
72 aa  57.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  41.79 
 
 
452 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 
367 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  30.58 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
270 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  29.51 
 
 
141 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  31.09 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  43.08 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  35.82 
 
 
378 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  39.19 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  42.42 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  32.98 
 
 
267 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  41.94 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  41.54 
 
 
268 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  40.32 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  32.98 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.06 
 
 
263 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  39.68 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  35.44 
 
 
374 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  39.39 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  34.26 
 
 
351 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
141 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  30.16 
 
 
257 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.41 
 
 
195 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  40.32 
 
 
69 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  43.08 
 
 
139 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  40 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
363 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  34.72 
 
 
278 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  37.88 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  46.03 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  37.5 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.19 
 
 
270 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.16 
 
 
380 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  34.85 
 
 
155 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>