37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2645 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  41.18 
 
 
353 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  37.98 
 
 
327 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2922  hypothetical protein  37.01 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  36.04 
 
 
298 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  35.87 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  31.54 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  41.82 
 
 
418 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  30.37 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  28.86 
 
 
434 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  27.27 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  40.68 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  40.38 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  40.38 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40.38 
 
 
423 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  40.38 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  38.46 
 
 
423 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  29.08 
 
 
464 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.13 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  42.86 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  39.19 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  30 
 
 
440 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  44.74 
 
 
418 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  44.74 
 
 
418 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  30.21 
 
 
301 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  30.08 
 
 
480 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  35.59 
 
 
409 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  26.88 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  26.85 
 
 
483 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  39.71 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  28.77 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25.68 
 
 
605 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0056  von Willebrand factor type A  21.99 
 
 
847 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.854643  normal  0.269901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  47.37 
 
 
437 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  24.48 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  26.39 
 
 
456 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  31.58 
 
 
414 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>